一、避免用于敏感作物和作物的敏感期。不同作物和品種對氯的敏感性和忍耐性有很大差異。對氯敏感的作物稱為忌氯作物，有煙草、茶葉、柑橘、葡萄、西瓜、馬鈴薯、紫云英等，一般不施或嚴格控制含氯化肥施用量。同一類作物不同品種抗氯性有差異，如水稻品種之間，以雜交稻耐氯性最強。常規早稻耐氯性較弱，且要避開作物的氯敏感期。作物的氯敏感期多在苗期，如水稻在3葉-5葉期；小麥在2葉期-5葉期；大白菜、小白菜和油菜在4葉-6葉期。
二、講究施用方法。用含氯化肥做基肥時應提早深施并蓋土，一般在播種或移苗前一個星期施用，施在種子或幼苗下側，以距表土5厘米-7厘米處為宜。作追肥時：采取穴施或條施，并與作物植株相距5厘米-10厘米，切忌撒施。施用量大時，可分2次-3次追施。追肥亦可兌水或兌稀糞尿水澆施。
三、盡量在降雨量較多的季節和地區施用。在多雨的季節或降水較多的地區施用含氯化肥，氯離子可隨水淋失，不易在土壤中積累，因而可避免對作物產生副作用。而無灌溉條件的旱地、排水不良的鹽堿地和高溫干旱季節以及缺水少雨地區最好不用或少用含氯化肥。
四、配合施用腐熟的有機肥和磷肥。在施用含氯化肥時，配合施用腐熟的有機肥，可以提高肥效，減輕氯離子對土壤的不良影響；在有效磷含量低的土壤中，氯離子對作物吸收磷有抑制作用。因此，施含氯化肥時應配施適量的磷肥。用含氯化肥與尿素、磷酸銨、過磷酸鈣、鈣鎂磷肥等配制而成的復（混）合肥、配方肥，不僅可以減輕氯離子的危害，而且由于氮、磷、鉀得到配合使用，可起到平衡施肥的效果。
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